Все успешно окончившие бакалавратуру и защитившие диплом на 5 поступают в магистратуру (Институт ядерной физики оплачивает обучение в магистратуре).

На ИЯФовских кафедрах устанавливается ежемесячная добавка к стипендии. На 3 курсе она безусловная, на 4-6 есть только у проходящих практику в ИЯФе, причем "четверка" по практике в НИИ снижает добавку вдвое, а "тройка" или несданная вовремя сессия лишает доплаты на семестр.

Надбавка не исключает трудоустройство лаборантами. Сумма надбавки выбрана с таким расчетом чтобы полный доход магистрантов был 1800 руб, а студентов 1500 руб, и у них не было бы необходимости подрабатывать на стороне.

На 1-2 курсе устанавливается благотворительные стипендии ИЯФ 20*300 руб. Стипендиаты определяются по алгоритму, близкому к выдачи матпомощи. Выдача стипендий широко рикламируется. Условие выдачи стипендий - подпись представителя института (из числа преподователей) на заявлении, чтобы у студентов были хоть какие-то моральные обязательства пойти в поддерживающий их институт.

С желающими магистрантами заключается ИЯФовский договор-контракт, который гарантирует доплату, чуть большую ИЯФовской кафедральной стипендии.

Лаборатории ИЯФа, как правило, участвуют в международных проектах. Аспиранты, а иногда и магистранты, участвуют в этих проектах, в том числе, проходят стажировку за рубежом (обычно 2-3 месяца), ездят на международные школы и конференции.

При обучении и научных исследованиях активно используются современные вычислительные средства, персональные компьютеры, и компьютеры общего пользования. При прохождении практики в лаборатории студенты имеют свободный доступ к интернету.

В соответствии с законом о воинской обязанности, пока вы учитесь в магистратуре, аспирантуре, вам дается отсрочка от службы в армии.